پروتیین‏های با کیفیت بالا و پروتیین‏های با کیفیت پایینبه دلیل شباهت بدن حیوانات به بدن انسان، پروتیین بدن آن‏ها نیز از نظر ترکیب اسید آمینه‏ها مشابه بدن ماست. به همین دلیل متخصصین، پروتیین‏های حیوانی مثل گوشت قرمز و سفید، ماهی تخم‏مرغ و لبنیات را پروتیین با کیفیت بالا می‏نامند. بدن ما این نوع پروتیین را آسان‏تر و بهتر جذب می‏کند. این نوع پروتیین می‏تواند با حداقل هدر رفتن باعث ایجاد بافت در بدن نشود. پروتیین‏های گیاهی مثل غلات، پروتیین‏های میوه و سبزی‏ها، حبوبات و دانه‏های روغنی میزان محدودی اسید آمینه‏ها دارند. بدن، به آسانی پروتیین‏های حیوانی قادر به جذب نیست؛ به عبارت دیگر کیفیت غذایی این مواد پروتیینی به اندازه‏ی پروتیین حیوانی نیست.